Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrm1P12657 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrm1P12657 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms