Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa1P11477 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa1P11477 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms