Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spp1P10923 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spp1P10923 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms