Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem254bP0DN90 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem254bP0DN90 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms