Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufb1P0DN34 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufb1P0DN34 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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