Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf1P09925 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf1P09925 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf1P09925 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms