Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtaP09225 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LtaP09225 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtaP09225 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtaP09225 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtaP09225 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtaP09225 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtaP09225 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms