Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1P09055 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1P09055 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms