Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NefmP08553 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefmP08553 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefmP08553 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefmP08553 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefmP08553 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NefmP08553 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NefmP08553 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NefmP08553 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefmP08553 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefmP08553 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefmP08553 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefmP08553 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefmP08553 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NefmP08553 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NefmP08553 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NefmP08553 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NefmP08553 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NefmP08553 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NefmP08553 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NefmP08553 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NefmP08553 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NefmP08553 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NefmP08553 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NefmP08553 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NefmP08553 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NefmP08553 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefmP08553 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefmP08553 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefmP08553 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefmP08553 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefmP08553 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NefmP08553 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NefmP08553 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NefmP08553 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NefmP08553 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NefmP08553 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms