Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spta1P08032 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spta1P08032 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Spta1P08032 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms