Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtslP06797 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtslP06797 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtslP06797 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtslP06797 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtslP06797 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtslP06797 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtslP06797 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CtslP06797 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtslP06797 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CtslP06797 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CtslP06797 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtslP06797 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtslP06797 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtslP06797 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtslP06797 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtslP06797 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtslP06797 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtslP06797 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms