Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa3P02831 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa3P02831 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms