Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01798 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01798 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01798 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01798 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01798 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01798 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01798 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms