Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms