Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Robo1O89026 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Robo1O89026 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Robo1O89026 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Robo1O89026 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Robo1O89026 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Robo1O89026 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo1O89026 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms