Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CpdO89001 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CpdO89001 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CpdO89001 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CpdO89001 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CpdO89001 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CpdO89001 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CpdO89001 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CpdO89001 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CpdO89001 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CpdO89001 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CpdO89001 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CpdO89001 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CpdO89001 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CpdO89001 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CpdO89001 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CpdO89001 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms