Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setdb1O88974 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms