Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cd160O88875 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd160O88875 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms