Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcnkO88874 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcnkO88874 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcnkO88874 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CcnkO88874 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms