Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops6O88545 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops6O88545 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops6O88545 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops6O88545 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms