Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms