Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms