Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly86O88188 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly86O88188 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly86O88188 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly86O88188 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly86O88188 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly86O88188 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly86O88188 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly86O88188 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly86O88188 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly86O88188 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly86O88188 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ly86O88188 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms