Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfnO70456 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfnO70456 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SfnO70456 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SfnO70456 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SfnO70456 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfnO70456 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfnO70456 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfnO70456 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfnO70456 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfnO70456 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms