Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb5O70309 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb5O70309 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb5O70309 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb5O70309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb5O70309 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb5O70309 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb5O70309 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb5O70309 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms