Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtogO55225 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtogO55225 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtogO55225 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtogO55225 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtogO55225 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtogO55225 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtogO55225 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtogO55225 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtogO55225 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtogO55225 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtogO55225 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtogO55225 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OtogO55225 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms