Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb2O55203 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb2O55203 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms