Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx4O55187 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx4O55187 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx4O55187 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx4O55187 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx4O55187 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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