Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyp26a1O55127 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26a1O55127 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms