Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mmp10O55123 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp10O55123 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms