Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nck2O55033 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nck2O55033 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nck2O55033 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms