Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb2O55029 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb2O55029 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb2O55029 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb2O55029 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms