Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DffaO54786 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DffaO54786 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DffaO54786 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DffaO54786 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DffaO54786 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DffaO54786 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DffaO54786 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DffaO54786 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DffaO54786 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DffaO54786 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DffaO54786 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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DffaO54786 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DffaO54786 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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DffaO54786 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DffaO54786 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DffaO54786 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DffaO54786 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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