Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr6O54689 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms