Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FxnO35943 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FxnO35943 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FxnO35943 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FxnO35943 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FxnO35943 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FxnO35943 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FxnO35943 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FxnO35943 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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FxnO35943 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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FxnO35943 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FxnO35943 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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FxnO35943 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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FxnO35943 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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FxnO35943 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FxnO35943 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FxnO35943 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FxnO35943 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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