Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NudcO35685 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NudcO35685 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NudcO35685 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NudcO35685 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NudcO35685 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NudcO35685 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NudcO35685 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NudcO35685 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NudcO35685 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NudcO35685 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NudcO35685 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NudcO35685 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NudcO35685 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NudcO35685 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NudcO35685 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NudcO35685 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NudcO35685 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NudcO35685 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NudcO35685 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NudcO35685 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NudcO35685 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NudcO35685 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NudcO35685 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NudcO35685 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NudcO35685 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms