Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch2O35516 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Notch2O35516 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Notch2O35516 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch2O35516 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch2O35516 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch2O35516 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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