Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clcn6O35454 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clcn6O35454 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms