Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf6bO35451 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf6bO35451 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms