Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ColqO35348 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ColqO35348 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ColqO35348 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ColqO35348 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ColqO35348 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ColqO35348 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ColqO35348 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ColqO35348 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ColqO35348 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ColqO35348 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ColqO35348 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ColqO35348 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ColqO35348 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ColqO35348 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ColqO35348 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms