Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptpn9O35239 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ptpn9O35239 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Ptpn9O35239 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ptpn9O35239 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ptpn9O35239 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ptpn9O35239 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ptpn9O35239 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptpn9O35239 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms