Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ltbp2O08999 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ltbp2O08999 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms