Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfil3O08750 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms