Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MttpO08601 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MttpO08601 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MttpO08601 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MttpO08601 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MttpO08601 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MttpO08601 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MttpO08601 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MttpO08601 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MttpO08601 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MttpO08601 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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