Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MsmbO08540 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MsmbO08540 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms