Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8050L7N2E3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8050L7N2E3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms