Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5849J3QPE5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5849J3QPE5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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