Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21897J3KMP5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms