Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf4bG5E8Z2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms