Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lcG5E8I7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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